目前，中国公益组织面临资金短缺和资源分配不均的双重挑战。资金短缺方面，2005年慈善捐款仅占全国GDP的0.05%，而印度的比例比中国高一倍，其他国家巴西接近0.3%，阿根廷约占1.1%，英国是0.84%，美国约占1.85%；[①]资源分配不均方面，政府扶持的公益组织占直接服务组织7%，却吸收了85%的现有资源，而规模较小的草根组织难以获得足够资助；除此之外，这些组织集中在上海和北京，而在大城市之外的公益组织却遭到了冷落。[②]同时，中国大陆公益专案缺乏“差异化”特色。公益项目多配合政府政策，选择少，缺乏差异化，许多跨国公司的CSR项目从调研、设计、执行、评估都需由公司自己执行，才能创造差异化优势。
    在上述背景下，非公募基金会由于既可扩大公益慈善的多元选择，又可以出资企业或个人命名，因此发展快速，截至08年底总数已超过600家。随着经济开放、和谐社会等政策的鼓励，预计未来成长数量将持续扩大。
    新兴的非公募基金虽然势头看好，却也面临下列发展问题：第一，亟需整合基金会发展所需的相关专业知识与能力，以因应未来发展挑战，例如基金会内部治理、责信及资讯透明，[③]社会创新战略规划、社会发展问题解决方案、社会服务项目绩效评估以及社会发展议题倡导及资源整合等等；[④]第二，非公募基金会依赖个人或企业捐助，除公益独立性容易招致质疑外，多数以传统慈善捐赠的方式进行的慈善公益，更会面临资金来源可持续的问题。
    针对基金会可持续发展的问题，国际上通常会以“社会企业”及“企业社会责任”两种战略来因应，前者以企业家精神，透过“社会创新（social innovation）”战略创收，落实可持续远景；后者则是透过“战略公益”战略，整合出资企业或其它相关企业，在产销人发财等功能政策及供应链运营上落实企业社会责任，一方面降低运营社会成本，另一方面，更可提升经营优势及绩效，良性循环回馈基金会，落实更广义的社会公益。